Nachdem Godzilla 1954, vor 50 Jahren, Tokio verwüstete und dann vom Militär zurück ins Meer gedrängt wurde, blieb er seit dem verschwunden.
Zwar tauchten irgendwo anders auf der Welt hier und da mal Monster auf, in Amerika sogar ein vermeintlicher Godzilla der sich aber doch nur ein recht ähnliches Monster war, aber in Japan herrschte Ruhe und Frieden und die Menschen begannen die Schrecken der Katastrophe zu vergessen. Nur die älteren, so wie General Taizo Tachibana, können sich noch gut an damals erinnern.

Dessen Tochter Yuri arbeitet indes bei einem kleinen privaten TV-Sender und dreht vor allem halbseidene Reportagen über angebliche mysteriöse Vorfälle quer durch Japan.
Als sie mit ihrem Team gerade mal wieder einer Legende über einen verwunschen Wald, in dem Leute verschwinden, nach geht, ereignet sich plötzlich ein Erdbeben und seltsame Schrei sind zu hören.
Im Folgenden ereignen sich einige seltsame Katstrophen bei denen vornehmlich randalierende Jugendliche das Opfer sind und bei denen die wenigen Überlebenden von riesigen Monstern berichten.

Auch das Militär ist derweil mit vermeintlichen Monster-Sichtungen beschäftigt, so wurde u. a. ein amerikanisches U-Boot zerstört. Bald schon steht fest, irgendetwas ist unterwegs nach Japan und im Land selber scheinen auch mysteriöse Dinge vor sich zu gehen.

Yuri stolpert inzwischen über eine alte Legende, die von drei heiligen Schutzmonstern berichtet, die erwachen sollen wenn Japan bedroht wird, und tatschlich nahmen die seltsamen Vorfälle genau an den Stellen ihren Anfang, an denen die Monster schlafen sollen.

Und tatsächlich, schon bald steht fest die Legende ist wahr.
Godzilla ist zurück gekehrt um Japan ein weiteres Mal zu verwüsten und die drei heiligen Schutzgötter machen sich auf sich ihm in den Weg zu stellen.

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